全自動刷式過濾器具有對原水進行過濾并自動對濾芯進行清洗排污的功能，且清洗排污時系統不間斷供水。全自動刷式過濾器的清洗有兩種控制方式：自動控制和手動控制。

自動控制：自動控制有定時和壓差兩個方式。在過濾時間定時器上設定過濾時間，當過濾時間到，啟動排污，排污時間由排污時間定時器設定;同時控制系統實時將系統壓差與用戶設定的壓差相比較，當系統壓差達設定壓差時，過濾器也進行清洗排污，排污時間由排污時間定時器設定。排污時間到，停止清洗，系統恢復至其初始狀態，為下一個過濾工序作好準備。

手動控制：將操作面板上的手動/自動選擇開關撥到手動位置，過濾器進行排污。